WPGMA は、Weighted Pair-Group Method with Arithmetic mean (算術平均を使用した加重ペア グループ法) の略です。

ローの数 n₁、n₂、および n₃ を含む、C₁、C₂、および C₃ という 3 つのクラスタがあるとします。クラスタ C₂ および C₃ が集計されて、C₄ という新しい単一クラスタが形成されます。

クラスタ C₁ と新しいクラスタ C₄ との距離は、以下のように計算されます。