La méthode de Ward revient à calculer la somme incrémentale des carrés. Distance euclidienne semi carrée est la seule mesure de distance pouvant être utilisée avec cette méthode de clustering. C'est pourquoi la mesure de distance est automatiquement définie sur Distance euclidienne semi carrée lorsque la méthode de Ward est sélectionnée.

Supposons qu'il existe trois clusters appelés C₁, C₂ et C₃ comprenant respectivement un nombre n₁, n₂ et n₃ de lignes (ou de colonnes). Les clusters C₂ et C₃ sont regroupés pour former un unique nouveau cluster appelé C₄.

La distance entre le cluster C₁ et le nouveau cluster C₄ dans l'exemple ci-dessus est calculée de la façon suivante :

où